RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SGCDQ92629 289 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJA3Q96EY1 480 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL5BQ96KC2 179 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP64Q9NPA5 681 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SSUH2Q9Y2M2 353 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ENTPD6O75354 484 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R3DO95685 299 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2ABP04908 130 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MLLT10P55197 1068 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENBP1Q13228 472 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC75AQ8NAA5 344 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2M7Q8NG81 312 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD8Q8NHS3 518 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H2ACQ93077 130 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HES7Q9BYE0 225 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGES3LE9PB15 166 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A10O95528 541 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CLPTM1O96005 669 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SP1P08047 785 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PEPDP12955 493 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF17P17021 662 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP2P41181 271 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT6P53370 316 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT14P1Q58G82 188 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A25Q6KCM7 469 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM122AQ96E09 287 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 LRR1Q96L50 414 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NRIP3Q9NQ35 241 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CMC2Q9NRP2 79 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR52Q9Y2T5 361 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BML4 177 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD7O75084 574 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM4O75871 244 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR1AP08908 422 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RFPL3SP0C7P2 107 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SGCBQ16585 318 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF773Q6PK81 442 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFL2Q6UWQ7 119 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFN1Q86VF2 1251 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SULF2Q8IWU5 870 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5J2Q8NH18 312 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 AMBNQ9NP70 447 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 BATF3Q9NR55 127 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP14Q9NWM8 211 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2M5A3KFT3 312 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCA1A8K7I4 914 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NME2P1O60361 137 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TFAP2AP05549 437 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TFPIP10646 304 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPDH2P12268 514 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NME2P22392 152 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GRPRP30550 384 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IDUAP35475 653 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD13AQ14CX5 517 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG10Q5BKT4 473 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A19Q695T7 634 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GGHQ92820 318 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FN3KQ9H479 309 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R5Q9NYW4 299 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC14L4Q9UDX3 406 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.43■■□□□ 1.18
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