RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 FMO6PO60774 539 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 COX4I1P13073 169 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 EDNRAP25101 427 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ITGADQ13349 1161 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NRF1Q16656 503 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ERICH5Q6P6B1 374 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 TMEM99Q8N816 258 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 MFSD8Q8NHS3 518 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NRGNQ92686 78 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SLC38A4Q969I6 547 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PRR14Q9BWN1 585 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PRSS50Q9UI38 385 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CADP27708 2225 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 A0A0B4J2E0 115 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 A0A1B0GX12 115 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SNX3O60493 162 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FZD7O75084 574 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 AKR7A3O95154 331 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 AHSA1O95433 338 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ADAP00813 363 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 THBDP07204 575 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CD247P20963 164 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 DRD4P21917 467 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CRYBA2P53672 197 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 OR1Q1Q15612 314 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 APH1AQ96BI3 265 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NTF4P34130 210 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 POU4F3Q15319 338 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 TREML1Q86YW5 311 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 NINJ1Q92982 152 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPR1 153 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 M0R3H8 397 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 VAMP5O95183 116 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 COX5AP20674 150 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 P2RY4P51582 365 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 FBXW9Q5XUX1 488 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 S100PBPQ96BU1 408 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 PARPBPQ9NWS1 579 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 SELENONQ9NZV5 590 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 EDARQ9UNE0 448 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-220ENST00000618056 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 A0A087WUJ7 227 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 OR2T1O43869 369 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 IL32P24001 234 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ZNF613Q6PF04 617 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 OR6T1Q8NGN1 323 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TMEM45BQ96B21 275 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 MCHR1Q99705 422 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 LIME1Q9H400 295 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 MALT1Q9UDY8 824 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 EBAG9O00559 213 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 NPTX1Q15818 432 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 FAM69AQ5T7M9 428 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 USP22Q9UPT9 525 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 F8P00451 2351 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 DSCAMO60469 2012 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 AIM2O14862 343 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 KLF4O43474 513 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 LOXP28300 417 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 CDH12P55289 794 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TSC22D1Q15714 1073 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 BEX5Q5H9J7 111 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-220ENST00000618056 TMEM225Q6GV28 225 aa21.99■■□□□ 1.11
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