RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 VWC2LB2RUY7 222 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 KLF11O14901 512 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 LMX1BO60663 402 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 NR2F1P10589 423 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 THBS2P35442 1172 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN2CP42773 168 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 NME5P56597 212 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 OR7A5Q15622 319 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 COX20Q5RI15 118 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF440Q8IYI8 595 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 RLIMQ9NVW2 624 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 CXCR1P25024 350 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 GZMKP49863 264 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PDLIM4P50479 330 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 GPAT4Q86UL3 456 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP7Q9Y680 259 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 CDHR4A6H8M9 788 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFS8O00217 210 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 GSNP06396 782 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PGRP06401 933 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 IL12AP29459 219 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK11Q15759 364 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PEX5LQ8IYB4 626 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 SORCS2Q96PQ0 1159 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 OR52E6Q96RD3 313 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PNPOQ9NVS9 261 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 AIG1Q9NVV5 245 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM45AQ9NWC5 275 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 TM9SF1O15321 606 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 GKN3PP0CG01 181 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 BGNP21810 368 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 NR4A2P43354 598 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 P2RY4P51582 365 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 GGTLC2Q14390 218 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 KRT71Q3SY84 523 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM225Q6GV28 225 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A2Q96QD8 506 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 KRT33AO76009 404 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PAX7P23759 505 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 IGFBP5P24593 272 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTPRF-216ENST00000617451 STX3Q13277 289 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTPRF-216ENST00000617451 CREB3L2Q70SY1 520 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 VRK2Q86Y07 508 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 OR52P1PQ8NH57 321 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PIMREGQ9BSJ6 248 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 KATNB1Q9BVA0 655 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PRR14Q9BWN1 585 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 CA10Q9NS85 328 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 A8MVM7 634 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF587BE7ETH6 402 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 SDHDO14521 159 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 VAMP5O95183 116 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 KRT75O95678 551 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 LGI1O95970 557 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 SELENOPP49908 381 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 LGALS3BPQ08380 585 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 MPP2Q14168 576 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 LIN52Q52LA3 116 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 FAM166AQ6J272 317 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF836Q6ZNA1 936 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 CADM2Q8N3J6 435 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 FOXN4Q96NZ1 517 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 KCNS3Q9BQ31 491 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 TAPBPLQ9BX59 468 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 KCNS2Q9ULS6 477 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 DSPPQ9NZW4 1301 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35F4A4IF30 521 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 CRYAAP02489 173 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 SRD5A1P18405 259 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 MVDP53602 400 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 COPZ1P61923 177 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD16Q6P6B7 361 aa21.69■■□□□ 1.06
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