RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP6V1HQ9UI12 483 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDH7Q9ULB5 785 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 R4GN34 69 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP10DQ9P241 1426 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 LAMB4A4D0S4 1761 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 FN1P02751 2386 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0U1RQV1 116 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 TTC26A0AVF1 554 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGEF35A5YM69 484 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR6C70A6NIJ9 312 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 BPY2O14599 106 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 CASKO14936 926 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ALOX15BO15296 676 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 RP2O75695 350 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 GFPT2O94808 682 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 YIF1AO95070 293 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 S1PR2O95136 353 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 GNA14O95837 355 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 APCSP02743 223 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRH1P02810 166 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 PFN1P07737 140 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMIM10L1P0DMW3 83 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 CASTP20810 708 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMOD1P28289 359 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD80P33681 288 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SYKP43405 635 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SRYQ05066 204 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERCC8Q13216 396 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 PTK6Q13882 451 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 TFDP1Q14186 410 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 LAGE3Q14657 143 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLMAPQ14BN4 828 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM222AQ5U5X8 452 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPATA1Q5VX52 437 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 KCTD11Q693B1 232 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRMT9Q6P2P2 845 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 BRINP3Q76B58 766 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR9A2Q8NGT5 310 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 LILRB4Q8NHJ6 448 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 AP2M1Q96CW1 435 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMIM10Q96HG1 83 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 AMDHD1Q96NU7 426 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 IP6K3Q96PC2 410 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5B2Q96R09 309 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 NDUFAF3Q9BU61 184 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SRMSQ9H3Y6 488 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 NARFQ9UHQ1 456 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ALG6Q9Y672 507 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 OOEPA6NGQ2 149 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 H3BMQ9 156 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAPBPO15533 448 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSPA4LO95757 839 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 BCHEP06276 602 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 HBQ1P09105 142 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF688P0C7X2 276 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDHBP11177 359 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAD23AP54725 363 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 HERVK_113P63132 956 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERVK-8P63133 956 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 FZD2Q14332 565 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDIA5Q14554 519 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 HES5Q5TA89 166 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 LCN12Q6JVE5 192 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEK5Q6P3R8 708 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 CBLN3Q6UW01 205 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMPPEQ6ZT21 453 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 BNIPLQ7Z465 357 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 THNSL1Q8IYQ7 743 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC35G3Q8N808 338 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms