RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F13BP05160 661 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FASLGP48023 281 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR143P51810 404 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRG3P56975 720 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIRPAP78324 504 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELOCQ15369 112 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL26Q53HC5 615 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OTPQ5XKR4 325 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT74Q7RTS7 529 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6C4Q8NGE1 309 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACOT12Q8WYK0 555 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM131Q92545 1883 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EFCAB7A8K855 629 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H7C1C5 153 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WISP1O95388 367 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPI1P17947 270 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATF1P18846 271 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB3BP20337 219 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MST1P26927 711 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD38P28907 300 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TALDO1P37837 337 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCN6P62502 163 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT13Q7L8C5 426 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADOQ96SZ5 270 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLCL2Q9UPR0 1127 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMLR1H3BR10 107 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FZD7O75084 574 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFI6P09912 130 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2T7P0C7T2 308 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS27P42677 84 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EFNA3P52797 238 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD17B7P56937 341 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R43P59537 309 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SKP1P63208 163 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTC1P68032 377 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTA1P68133 377 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR176Q14439 515 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK5R1Q15078 307 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q5BKY6 102 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEG1Q6P5S2 330 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELOA3Q8NG57 546 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2T27Q8NH04 317 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD17B8Q92506 261 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2B2Q9GZK3 357 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDE7BQ9NP56 450 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCDNQ9UBB6 729 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.78□□□□□ -0.68
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BSH0 61 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCTN6O00399 190 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF749O43361 778 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD3GP09693 182 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EDNRAP25101 427 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PITPNBP48739 271 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIO1P49895 249 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIN1Q13671 783 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM19Q96E16 107 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDOQ99489 341 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCG5Q9H222 651 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD61A6NGH8 418 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6C70A6NIJ9 312 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACOD1A6NK06 481 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR7A10O76100 309 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPP14O95059 124 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPR2P20594 1047 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC37A1P57057 533 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EGR4Q05215 589 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LTBQ06643 244 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POU4F2Q12837 409 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP78Q5JTW2 689 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6orf183Q5T699 404 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MS4A15Q8N5U1 240 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF170Q96K19 258 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX18Q96RF0 628 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.77□□□□□ -0.69
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.8 ms