RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	DNPH1	O43598	174 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	FCMR	O60667	390 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	KRT34	O76011	436 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	AKR7A3	O95154	331 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	HSPA4L	O95757	839 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CDC25B	P30305	580 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	RYK	P34925	604 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	KIAA0040	Q15053	153 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	GPR68	Q15743	365 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MAPK14	Q16539	360 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	UGT2B17	O75795	530 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SEC14L2	O76054	403 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CSTA	P01040	98 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	STX2	P32856	288 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	PGM1	P36871	562 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MAGEA4	P43358	317 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	EVX1	P49640	407 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	P2RY4	P51582	365 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CCL8	P80075	99 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	NAB1	Q13506	487 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SDF2	Q99470	211 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CLDN24	A6NM45	220 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	AP3D1	O14617	1153 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	KRT33A	O76009	404 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF35	P13682	527 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SELE	P16581	610 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SLC35A1	P78382	337 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	PDE7A	Q13946	482 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF141	Q15928	474 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	RAB8B	Q92930	207 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TSSK3	Q96PN8	268 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TIMM23	O14925	209 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	TBX19	O60806	448 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	CLPTM1	O96005	669 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	SDC1	P18827	310 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NUP62-216	ENST00000599560	GATA3	P23771	443 aa		10.28	□□□□□ -0.76

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