RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SERTAD3Q9UJW9 196 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SERINC4A6NH21 518 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 C21orf140B9A014 251 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PEPDP12955 493 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 HK1P19367 917 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SSTR4P31391 388 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD7P51665 324 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAM1Q15629 374 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 DOK4Q8TEW6 326 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 GATAD2BQ8WXI9 593 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 BARHL1Q9BZE3 327 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 DYRK3O43781 588 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF8P32971 234 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1E1P36543 226 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PSPHP78330 225 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG10BQ5I7T1 473 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A16Q86VW1 577 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM71CQ8NEG0 241 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.22■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABCB10Q9NRK6 738 aa23.22■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL21Q9UJP4 597 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO18BQ8IUG5 2567 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TBX1O43435 398 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 CDRT1O95170 752 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SAGP10523 405 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF3P17036 446 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R43P59537 309 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTC1P68032 377 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTA1P68133 377 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 STEAP3Q658P3 488 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 BCORP1Q8N888 145 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4F15Q8NGB8 312 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT27Q9BW83 186 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SNTG1Q9NSN8 517 aa23.21■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 WWP2O00308 870 aa23.2■■□□□ 1.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF527Q8NB42 609 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13C2Q8NGS9 318 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCO6Q96DC7 493 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 NEURL2Q9BR09 285 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR87Q9BY21 358 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10H1Q9Y4A9 318 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BMH7 237 aa23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 CTDSP2O14595 271 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 SCRG1O75711 98 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A10O95528 541 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 TLE1Q04724 770 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 GALEQ14376 348 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL26Q53HC5 615 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP54Q7Z3B4 507 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 OAFQ86UD1 273 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 LHFPL3Q86UP9 236 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 BBS1Q8NFJ9 593 aa23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 CUTCQ9NTM9 273 aa23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLPSP04118 112 aa23.18■■□□□ 1.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 C22orf42Q6IC83 251 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC37A3Q8NCC5 494 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF217Q8TC41 542 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 SGTBQ96EQ0 304 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 ART5Q96L15 291 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNS3Q9BQ31 491 aa23.18■■□□□ 1.3
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