RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	RHCE	P18577	417 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	GRPR	P30550	384 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	IFNA8	P32881	189 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SLC35A1	P78382	337 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	LAPTM4A	Q15012	233 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TRAM2	Q15035	370 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SEC23B	Q15437	767 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CDSN	Q15517	529 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	VWA1	Q6PCB0	445 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	KDM8	Q8N371	416 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	RND1	Q92730	232 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	WNT2B	Q93097	391 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MPP4	Q96JB8	637 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PIP5K1A	Q99755	562 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF175	Q9Y473	711 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	C11orf98	E9PRG8	122 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	FKBP6	O75344	327 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	TIPRL	O75663	272 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	SERPINI2	O75830	405 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	OR7A10	O76100	309 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	GADD45G	O95257	159 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	LDLR	P01130	860 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RAP2A	P10114	183 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	FCGR2A	P12318	317 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	ITGA2	P17301	1181 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	MAK	P20794	623 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	GPR4	P46093	362 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	IST1	P53990	364 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RAC3	P60763	192 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	NRM	Q8IXM6	262 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RNF128	Q8TEB7	428 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	SGTB	Q96EQ0	304 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	EPYC	Q99645	322 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	TM9SF2	Q99805	663 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	CHID1	Q9BWS9	393 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	UCK2	Q9BZX2	261 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RNF122	Q9H9V4	155 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	MED31	Q9Y3C7	131 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744		U3KQV3	271 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	RELN	P78509	3460 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087WUU8	490 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1W2PNV4	684 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744		A1L4Q6	167 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RPL4-208	ENST00000564744	AQP7P3	A6NL99	342 aa		7.57	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms