RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RBBP4	Q09028	425 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PPA1	Q15181	289 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MRGBP	Q9NV56	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	VPS13C	Q709C8	3753 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OVOL3	O00110	214 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TPST1	O60507	370 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SERPINB7	O75635	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AKR7A3	O95154	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PNMT	P11086	282 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC6A2	P23975	617 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	BNIP2	Q12982	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SCARB2	Q14108	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR7A5	Q15622	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	GABRA6	Q16445	453 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137		Q5PR19	223 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RETREG3	Q86VR2	466 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	P3H2	Q8IVL5	708 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CGREF1	Q99674	301 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RASD1	Q9Y272	281 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137		A0A0G2JND7	137 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ANGPT2	O15123	496 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR2T1	O43869	369 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FMO6P	O60774	539 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MFN2	O95140	757 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AHSA1	O95433	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NPPA	P01160	153 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C8B	P07358	591 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ITGA5	P08648	1049 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PAX7	P23759	505 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PTAFR	P25105	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	HTR2A	P28223	471 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MPG	P29372	298 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TGFBR3	Q03167	851 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FAP	Q12884	760 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	COQ5	Q5HYK3	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ULK3	Q6PHR2	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137		A0A1B0GWA3	101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CIB4	A0PJX0	185 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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