RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 GRINAQ7Z429 371 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SERPINA11Q86U17 422 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HIPK4Q8NE63 616 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RCN3Q96D15 328 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 STARD4Q96DR4 205 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ARL5BQ96KC2 179 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ECSITQ9BQ95 431 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RNF122Q9H9V4 155 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TIGARQ9NQ88 270 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 USP22Q9UPT9 525 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMEM72A0PK05 275 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 A6NNC1 897 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RNF212BA8MTL3 300 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 H7C1Q1 480 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FXYD1O00168 92 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SULT2B1O00204 365 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SERPINB7O75635 380 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NPPAP01160 153 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OPN1SWP03999 348 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 UQCRBP14927 111 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ENPP1P22413 925 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SLC1A3P43003 542 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ASCL1P50553 236 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 GZMMP51124 257 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 COPZ1P61923 177 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 DMTNQ08495 405 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 BNIP2Q12982 314 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SYT14P1Q58G82 188 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 COQ5Q5HYK3 327 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RNF220Q5VTB9 566 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZNF550Q7Z398 422 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 COMTD1Q86VU5 262 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 KRT73Q86Y46 540 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SMYD1Q8NB12 490 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZNF607Q96SK3 696 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SH3GL1Q99961 368 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ADAM19Q9H013 955 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 GID8Q9NWU2 228 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 A8MXE2 369 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FAAHO00519 579 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 SLC22A2O15244 555 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 MFN2O95140 757 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CRHP06850 196 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FCGR2AP12318 317 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CXCR1P25024 350 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PRKAR1BP31321 381 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 HTR3AP46098 478 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CPA2P48052 419 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 DIO1P49895 249 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 CTBP2P56545 445 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 OR2B6P58173 313 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RAC3P60763 192 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 RBBP4Q09028 425 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 DUSP7Q16829 419 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 VMACQ2NL98 169 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 C4orf46Q504U0 113 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FCRLAQ7L513 359 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-217ENST00000550044 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms