RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 RLIMQ9NVW2 624 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LMX1BO60663 402 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PGRP06401 933 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 BNIP2Q12982 314 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 STX3Q13277 289 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 COX20Q5RI15 118 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 VRK2Q86Y07 508 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM45BQ96B21 275 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SORT1Q99523 831 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A096LPE4 126 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A1W2PPZ6 126 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LIPT2A6NK58 231 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AQP7P3A6NL99 342 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF587BE7ETH6 402 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 RFXANKO14593 260 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TM9SF1O15321 606 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ANP32DO95626 131 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT75O95678 551 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LGI1O95970 557 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CRYAAP02489 173 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SRD5A1P18405 259 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SERPINF1P36955 418 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CRATP43155 626 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 GZMKP49863 264 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SELENOPP49908 381 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TUBA1BP68363 451 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TUBA4AP68366 448 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LGALS3BPQ08380 585 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 GSTA3Q16772 222 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 LIN52Q52LA3 116 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM166AQ6J272 317 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 NIPAL3Q6P499 406 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TUBA1AQ71U36 451 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ANKS4BQ8N8V4 417 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ZIC4Q8N9L1 334 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 OR52P1PQ8NH57 321 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SORCS2Q96PQ0 1159 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC38A2Q96QD8 506 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAM19Q9H013 955 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 MEAF6Q9HAF1 191 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 CA10Q9NS85 328 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 AIG1Q9NVV5 245 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM160Q9NX00 188 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 STAB1Q9NY15 2570 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-205ENST00000549039 FREM1Q5H8C1 2179 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 CDHR4A6H8M9 788 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 A8MVM7 634 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFS8O00217 210 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 NR5A2O00482 541 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 FAAHO00519 579 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 BCHEP06276 602 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 OR4A8P0C604 315 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 IGFBP5P24593 272 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 IL12AP29459 219 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 NR4A2P43354 598 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 MST1LQ2TV78 715 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 ATG16L1Q676U5 607 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 NXNQ6DKJ4 435 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 CREB3L2Q70SY1 520 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-205ENST00000549039 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms