RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF74	Q16587	644 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OAF	Q86UD1	273 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	MIB2	Q96AX9	1013 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	FEV	Q99581	238 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TIMP4	Q99727	224 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	USP24	Q9UPU5	2620 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PRRG2	O14669	202 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	EI24	O14681	340 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	DNPH1	O43598	174 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CXCL13	O43927	109 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	GAST	P01350	101 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	BGLAP	P02818	100 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	IMPDH2	P12268	514 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	EDN3	P14138	238 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CPN1	P15169	458 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	ENPP1	P22413	925 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PRKACG	P22612	351 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	FPR3	P25089	353 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PEX2	P28328	305 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	GRPR	P30550	384 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OMP	P47874	163 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TDGF1P3	P51864	188 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RAD23A	P54725	363 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CASP6	P55212	293 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RAC3	P60763	192 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TSPAN31	Q12999	210 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	DAG1	Q14118	895 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	C3AR1	Q16581	482 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	LPCAT4	Q643R3	524 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	GGN	Q86UU5	652 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CBR4	Q8N4T8	237 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	FANK1	Q8TC84	345 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	OSTF1	Q92882	214 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658		H3BN98	237 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658		M0R082	166 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	AKR7A3	O95154	331 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RCBTB2	O95199	551 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	HPR	P00739	348 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	FCGR2A	P12318	317 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	GABRA1	P14867	456 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	MAK	P20794	623 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	AHCY	P23526	432 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	GSS	P48637	474 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	MLLT10	P55197	1068 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	PRPS1	P60891	318 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	COX10	Q12887	443 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
DDB1-223	ENST00000543658	RFX4	Q33E94	735 aa		10.67	□□□□□ -0.7

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