RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	RELT	Q969Z4	430 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-224	ENST00000534730	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	LIPT2	A6NK58	231 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	GPR171	O14626	319 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	EFNA2	O43921	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CXCL13	O43927	109 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	E2F6	O75461	281 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PRSS23	O95084	383 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	LDLR	P01130	860 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PDK3	Q15120	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	HSPB2	Q16082	182 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	NANS	Q9NR45	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MED12	Q93074	2177 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MPDZ	O75970	2070 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PNR3	127 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730		A1L4Q6	167 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CCL21	O00585	134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CLDN1	O95832	211 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	IL11	P20809	199 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	COL8A1	P27658	744 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SLC9A3	P48764	834 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CTBP2	P56545	445 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PON3	Q15166	354 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	OR7A5	Q15622	319 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	C3AR1	Q16581	482 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RND1	Q92730	232 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	NPAS1	Q99742	590 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730		H0YHG0	523 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730		J3KTA2	159 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	FFAR1	O14842	300 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CLOCK	O15516	846 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	FZD7	O75084	574 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CCNB2	O95067	398 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	RCBTB2	O95199	551 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	LYPD3	O95274	346 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	FPR1	P21462	350 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PRKCD	Q05655	676 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CCNI	Q14094	377 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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