RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RYKP34925 604 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOPP49908 381 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR6P50406 440 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3F3AP84243 136 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRTP1Q5TC63 336 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLC3Q6P597 504 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP51Q70EK9 711 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF563Q8TA94 476 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST8SIA1Q92185 356 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB1CQ92928 201 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BOD1Q96IK1 185 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF225Q9UK10 706 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRRM5B3KS81 715 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDPK1O15530 556 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ULK1O75385 1050 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERLIN1O75477 346 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLPXO76031 633 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT6AP02538 564 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT6BP04259 564 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAX7P23759 505 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARR3P36575 388 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYBB2P43320 205 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT6CP48668 564 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP12AP54707 1039 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROK1P58294 105 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35A1P78382 337 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGFQ07326 219 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HFEQ30201 348 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MROH9Q5TGP6 573 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM234Q8WY98 164 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL17Q92583 94 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM45BQ96B21 275 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR78Q96P69 363 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAT2Q9GZY6 243 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DECR2Q9NUI1 292 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACER3Q9NUN7 267 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.63□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLXNB1O43157 2135 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM159BA6NKW6 160 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf100A8MU93 164 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YL77 283 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHHO43323 396 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNPH1O43598 174 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR7A3O95154 331 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL2O95198 593 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA4LO95757 839 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLPTM1O96005 669 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IMPDH2P12268 514 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD3B1P14060 373 aa8.62□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD3B2P26439 372 aa8.62□□□□□ -1.03
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