RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CXCR1P25024 350 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 TUBA1BP68363 451 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 TUBA4AP68366 448 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 MAPK11Q15759 364 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 TUBA1AQ71U36 451 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 PROX1Q92786 737 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM45BQ96B21 275 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 SHARPINQ9H0F6 387 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 CHODLQ9H9P2 273 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 AIG1Q9NVV5 245 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 NR5A2O00482 541 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT33AO76009 404 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 LGI1O95970 557 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 WNT11O96014 354 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 GPIP06744 558 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 BMP4P12644 408 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 STX3Q13277 289 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 GNA13Q14344 377 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 CENPHQ9H3R5 247 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 SVEP1Q4LDE5 3571 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC35F4A4IF30 521 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 AQP7P3A6NL99 342 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 FAAHO00519 579 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SDHDO14521 159 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 LMX1BO60663 402 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 PGRP06401 933 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 PRG2P13727 222 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SELENOPP49908 381 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM225Q6GV28 225 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 VHLLQ6RSH7 139 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 LINGO2Q7L985 606 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 CSF3P09919 207 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 ETFAP13804 333 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 UQCRBP14927 111 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 IGFBP5P24593 272 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 PDLIM4P50479 330 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 BST1Q10588 318 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 OR1K1Q8NGR3 316 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM160Q9NX00 188 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 HAO1Q9UJM8 370 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A096LPE4 126 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PPZ6 126 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 CDHR4A6H8M9 788 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 VWC2LB2RUY7 222 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 UPK3AO75631 287 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 EPHA3P29320 983 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 P2RY4P51582 365 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 GSTA3Q16772 222 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 OGFOD2Q6N063 350 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 NIPAL3Q6P499 406 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 KDM8Q8N371 416 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 PRR14Q9BWN1 585 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 TM9SF1O15321 606 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 BCHEP06276 602 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 CRATP43155 626 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 NR4A2P43354 598 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 GTDC1Q4AE62 458 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 CREB3L2Q70SY1 520 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBTB18Q99592 522 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms