RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 SLC48A1Q6P1K1 146 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 RRM2BQ7LG56 351 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM251Q8N6I4 163 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 TEX9Q8N6V9 391 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A28Q96A46 364 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 MRGBPQ9NV56 204 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 SNX24Q9Y343 169 aa3.78□□□□□ -1.8
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF175Q9Y473 711 aa3.78□□□□□ -1.8
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HDAC2-216ENST00000523628 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 SEC14L5O43304 696 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 RAD51CO43502 376 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 TBX19O60806 448 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 TOXO94900 526 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 RCBTB2O95199 551 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 GUSBP08236 651 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 ETFAP13804 333 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 ELK4P28324 431 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SSTR1P30872 391 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 CDAP32320 146 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 RASSF2P50749 326 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 XKP51811 444 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 GUCY2DQ02846 1103 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.77□□□□□ -1.81
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HDAC2-216ENST00000523628 CEBPEQ15744 281 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 GSTA3Q16772 222 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 IMPG1Q17R60 797 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 SMU1Q2TAY7 513 aa3.77□□□□□ -1.81
HDAC2-216ENST00000523628 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
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