RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HFEQ30201 348 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STUMQ69YW2 141 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCN12Q6JVE5 192 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GUSBP11Q6P575 273 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM47EQ6ZV65 393 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC17Q8N6Y2 441 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM105Q8N8V8 129 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST8SIA1Q92185 356 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELMO2Q96JJ3 720 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC114Q96M63 670 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF157Q96PX1 679 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFKBIZQ9BYH8 718 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIRPDQ9H106 197 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCG4Q9H172 646 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF167Q9H6Y7 350 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPV5Q9NQA5 729 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM153AQ9UHL3 310 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPIPA1Q9UND3 350 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIPT1Q9Y234 373 aa-0.17□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR62O43379 1518 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF716A6NP11 495 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H7C0S8 307 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCTN6O00399 190 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1G1O75348 118 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CGB3P0DN86 165 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UROSP10746 265 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF250P15622 560 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCP1P17987 556 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN6P29350 595 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOX6P35712 828 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFSF9P41273 254 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC7A9P82251 487 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB40BQ12829 278 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NME3Q13232 169 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDIA5Q14554 519 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLMAPQ14BN4 828 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYTH1Q15438 398 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TYSND1Q2T9J0 566 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADPRMQ3LIE5 342 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTLL9Q3SXZ7 439 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB134Q4QY38 66 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2G6Q5TZ20 316 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIGD3Q6B0B8 471 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PET117Q6UWS5 81 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CES3Q6UWW8 571 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00173Q6ZV60 143 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VSTM4Q8IW00 320 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYCP3Q8IZU3 236 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BATF2Q8N1L9 274 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC54Q8NEL0 328 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF680Q8NEM1 530 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51G2Q8NGK0 314 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01560Q8TB33 94 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF11Q92914 225 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP36Q96G28 342 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAHD2AQ96GK7 314 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF607Q96SK3 696 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGK2Q9HBY8 427 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTPS2Q9NRF8 586 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf123Q9NWV4 160 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNN3Q9UGI6 736 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAD2L2Q9UI95 211 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD84Q9UIB8 345 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANAPC7Q9UJX3 599 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCN1AP35498 2009 aa-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NACADO15069 1562 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP10DQ9P241 1426 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C12orf77C9JDV5 145 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 E9PMD0 336 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H3BTX0 84 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGK494L7N484 410 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBXN8O00124 270 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC31A2O15432 143 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC7A4O43246 635 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JAK2O60674 1132 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RP2O75695 350 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHDP01880 384 aa-0.19□□□□□ -2.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD74P04233 296 aa-0.19□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms