RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	RCN3	Q96D15	328 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A0B4J2E0	115 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A1B0GX12	115 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	FZD7	O75084	574 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	LYZL6	O75951	148 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	AHSA1	O95433	338 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	COX5A	P20674	150 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	IL32	P24001	234 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	GYS2	P54840	703 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	TAB1	Q15750	504 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	NRF1	Q16656	503 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	NINJ1	Q92982	152 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	TAAR8	Q969N4	342 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	CCDC22	O60826	627 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ATE1	O95260	518 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	C8B	P07358	591 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	PNMT	P11086	282 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	COX4I1	P13073	169 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	DRD4	P21917	467 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ART1	P52961	327 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A087WUJ7	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	THY1	P04216	161 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LSP1	P33241	339 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	CDH12	P55289	794 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	NCALD	P61601	193 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	CASP12	Q6UXS9	341 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	MCHR1	Q99705	422 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	MALT1	Q9UDY8	824 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	PDLIM1	O00151	329 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	AIM2	O14862	343 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	SNX3	O60493	162 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	FMO6P	O60774	539 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SERF1B-208	ENST00000515588	LYPD3	O95274	346 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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