RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 VDAC3Q9Y277 283 aa10.19□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.19□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.19□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0B4J2E0 115 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GX12 115 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PRQ8 180 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 C7orf72A4D263 438 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01387J3KSC0 135 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FFAR1O14842 300 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CHP2O43745 196 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 E2F6O75461 281 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS23O95084 383 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 HPNP05981 417 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ANPEPP15144 967 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 BMP7P18075 431 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 KLK2P20151 261 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TACR3P29371 465 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TIMP3P35625 211 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 HMGA2P52926 109 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CDH12P55289 794 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 MERTKQ12866 999 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 DGCR6Q14129 220 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.782e-20■■■■□ 19.3
UBE2B-208ENST00000511807 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PLPPR5Q32ZL2 321 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 DCST1Q5T197 706 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 VASNQ6EMK4 673 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 AMIGO2Q86SJ2 522 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00471Q8N535 108 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FAM222BQ8WU58 562 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf49Q96BT1 292 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 POM121Q96HA1 1249 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 DHRS1Q96LJ7 313 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 EPYCQ99645 322 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PKP2Q99959 881 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OR2B2Q9GZK3 357 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 UBQLN3Q9H347 655 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 EDARQ9UNE0 448 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF407Q9C0G0 2248 aa10.18□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 HCFC1P51610 2035 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WUJ7 227 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FAM221AA4D161 298 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 B4DXG7 233 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZIC3O60481 467 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF17P17021 662 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FPR1P21462 350 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RBM34P42696 430 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FGD3Q5JSP0 725 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RAET1LQ5VY80 246 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 KIF18BQ86Y91 864 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SVOPLQ8N434 492 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OR52J3Q8NH60 311 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 NRBF2Q96F24 287 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 KLHDC3Q9BQ90 382 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 OSGIN1Q9UJX0 560 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TMED7Q9Y3B3 224 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa10.17□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CD8B2A6NJW9 211 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF208O43345 1280 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CCNB2O95067 398 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 NTN1O95631 604 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ATP6V1G2O95670 118 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CTSSP25774 331 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ELK4P28324 431 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 IFNGR2P38484 337 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SLC34A1Q06495 639 aa10.16□□□□□ -0.78
UBE2B-208ENST00000511807 FOXF1Q12946 379 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms