RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 UPB1Q9UBR1 384 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TBK1Q9UHD2 729 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 EMCNQ9ULC0 261 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 A8MVM7 634 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 AZIN1O14977 448 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PIP5K1BO14986 540 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 UBL3O95164 117 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PTHP01270 115 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MYL2P10916 166 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FPR2P25090 351 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ARRB2P32121 409 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EMX2Q04743 252 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FBLN7Q53RD9 439 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CBLN3Q6UW01 205 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 REC114Q7Z4M0 266 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ABCA4P78363 2273 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GWJ7 208 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 GMNCA6NCL1 334 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C17orf51A8MQB3 221 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 J3QW42 95 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 RAD51DO75771 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CECR9P0C854 216 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 BCKDHAP12694 445 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF12P17014 697 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 NTF4P34130 210 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CRYBB2P43320 205 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZP4Q12836 540 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 C3orf56Q8N813 242 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 NANPQ8TBE9 248 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC115Q96NT0 180 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OXGR1Q96P68 337 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0G2JMP0 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0X1KG70 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM72A0PK05 275 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 AGAP5A6NIR3 686 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FRS3O43559 492 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CLPXO76031 633 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CSTAP01040 98 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV2-5P01817 119 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EPHA1P21709 976 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ECHS1P30084 290 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SFTPDP35247 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PLTPP55058 493 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 GGTLC2Q14390 218 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 RINLQ6ZS11 566 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM123Q8N131 208 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 STON2Q8WXE9 905 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ZFHX3Q15911 3703 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 AIM2O14862 343 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 PLIN3O60664 434 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SLC43A1O75387 559 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 THBS4P35443 961 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 LIN52Q52LA3 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SGO1Q5FBB7 561 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 AAED1Q7RTV5 226 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-210ENST00000503258 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.63□□□□□ -1.35
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