RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	NANS	Q9NR45	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	VNN3	Q9NY84	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711		U3KQV3	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711		A0A0J9YW62	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711		J3QL48	77 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PRRG2	O14669	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SEC14L5	O43304	696 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	WDR1	O75083	606 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OR7A10	O76100	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	VAMP5	O95183	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	BGLAP	P02818	100 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ABO	P16442	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	STAR	P49675	285 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	DIO1	P49895	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CASP6	P55212	293 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CLDN15	P56746	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CLDN20	P56880	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OR2B6	P58173	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SEC23B	Q15437	767 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SGCB	Q16585	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF74	Q16587	644 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	GGN	Q86UU5	652 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OSTF1	Q92882	214 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	TNFSF11	O14788	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	WISP1	O95388	367 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	CH25H	O95992	272 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	FUT1	P19526	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ENPP1	P22413	925 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OMP	P47874	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PRPS1	P60891	318 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SRY	Q05066	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OR7A5	Q15622	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OAF	Q86UD1	273 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	OR5J2	Q8NH18	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	EME1	Q96AY2	570 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNX17-208	ENST00000493711	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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