RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 AQP7P3A6NL99 342 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 TGDSO95455 350 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 CXCR1P25024 350 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 FADDQ13158 208 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 OR7A5Q15622 319 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 TTMPQ5BVD1 217 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 CADM2Q8N3J6 435 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 OR9K2Q8NGE7 335 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 GMEB1Q9Y692 573 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 FRS3O43559 492 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFS7O75251 213 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV4-39P01824 125 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 GPIP06744 558 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 ZSWIM7Q19AV6 140 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 COMTD1Q86VU5 262 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 A8MVM7 634 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 FTCDNL1E5RQL4 147 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 E7EQL1 145 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 CD40P25942 277 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 CDH11P55287 796 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 EGR4Q05215 589 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 PAGE3Q5JUK9 113 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 OR7E24Q6IFN5 339 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 B3GLCTQ6Y288 498 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 PIF1Q9H611 641 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 PARPBPQ9NWS1 579 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 IFT52Q9Y366 437 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 SONP18583 2426 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-211ENST00000490677 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 FZD7O75084 574 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PTAFRP25105 342 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF83P51522 516 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 HOXC5Q00444 222 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC12BQ2HXU8 276 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF311Q5JNZ3 666 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C9orf135Q5VTT2 229 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf140Q5VVS0 124 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf71Q6IPW1 123 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35B4Q969S0 331 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 BOD1Q96IK1 185 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 RADILQ96JH8 1075 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC28BQ9BUN5 200 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PTDSS2Q9BVG9 487 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 IKZF5Q9H5V7 419 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SLC17A5Q9NRA2 495 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 VAPAQ9P0L0 249 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF232Q9UNY5 417 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ARAFP10398 606 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 COPZ1P61923 177 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ETFDHQ16134 617 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM108Q6UXF1 575 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 BBS10Q8TAM1 723 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC8CQ8TDW0 803 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SPDL1Q96EA4 605 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PTNP21246 168 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ACVR1BP36896 505 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 STX1BP61266 288 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf78Q8N4C9 275 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 STK35Q8TDR2 534 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 RAD21L1Q9H4I0 556 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 UPB1Q9UBR1 384 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 MGAT4BQ9UQ53 548 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ETS2P15036 469 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 MPGP29372 298 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 LGALS3BPQ08380 585 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 CREB3L2Q70SY1 520 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 AAED1Q7RTV5 226 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM247A6NEH6 219 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 NR5A2O00482 541 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 HTR2AP28223 471 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TTKP33981 857 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 AQP5P55064 265 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 VEZF1Q14119 521 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL17Q6TDP4 642 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 LINGO2Q7L985 606 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GPAT4Q86UL3 456 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms