RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa1.13□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 CHADO15335 359 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RS1O15537 224 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MBTPS2O43462 519 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 CXCL13O43927 109 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 CBR3O75828 277 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ADCY5O95622 1261 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MBD3O95983 291 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 LGALS2P05162 132 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 DCNP07585 359 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 H2BFMP0C1H6 154 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 CISD3P0C7P0 127 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NPR2P20594 1047 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 DNAJB1P25685 340 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PSMA2P25787 234 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ANXA13P27216 316 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 YWHABP31946 246 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 BTCP35070 178 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 HPCAL1P37235 193 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 GLP1RP43220 463 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ASMTP46597 345 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RABIFP47224 123 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ATP6AP1Q15904 470 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RFX4Q33E94 735 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 LRRC8BQ6P9F7 803 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ZNF620Q6ZNG0 422 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MYOCDQ8IZQ8 938 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 DHRSXQ8N5I4 330 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 FAM86B1Q8N7N1 296 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 OR4D9Q8NGE8 314 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PAGE5Q96GU1 130 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 LINC00477Q96M19 166 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 TMEM246Q9BRR3 403 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 SPXQ9BT56 116 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ALG12Q9BV10 488 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 DNTTIP1Q9H147 329 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 CLMPQ9H6B4 373 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NGBQ9NPG2 151 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 QPCTLQ9NXS2 382 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 STAP1Q9ULZ2 295 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 SLC25A15Q9Y619 301 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 LRP4O75096 1905 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NCAPD2Q15021 1401 aa1.12□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 TRDCB7Z8K6 153 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RASGRF2O14827 1237 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 BET1O15155 118 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 B4GALT5O43286 388 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ENTPD5O75356 428 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NEBLO76041 1014 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 TRIM16O95361 564 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 C6orf47O95873 294 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 TLX1NBP0CAT3 122 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RFC4P35249 363 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 SLC26A3P40879 764 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 AP3M2P53677 418 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PLA2G16P53816 162 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 SPIBQ01892 262 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 UBE2SQ16763 222 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PARP15Q460N3 678 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 OR2G6Q5TZ20 316 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NANOGP8Q6NSW7 305 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PLBD1Q6P4A8 553 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 LYPD2Q6UXB3 125 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 SLC26A11Q86WA9 606 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ARRDC1Q8N5I2 433 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 OR4F15Q8NGB8 312 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 OR4K14Q8NGD5 310 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 OR10A7Q8NGE5 316 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 OR10G9Q8NGN4 311 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MGARPQ8TDB4 240 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 MCOLN3Q8TDD5 553 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 ZFP90Q8TF47 636 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RMI2Q96E14 147 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 FICDQ9BVA6 458 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 SRMSQ9H3Y6 488 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 NINJ2Q9NZG7 142 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 GNG12Q9UBI6 72 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 TBK1Q9UHD2 729 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RASD1Q9Y272 281 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 KNSTRNQ9Y448 316 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PCM1Q15154 2024 aa1.11□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PCNX2A6NKB5 2137 aa1.1□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa1.1□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 PLAC8L1A1L4L8 177 aa1.1□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 GSAPA4D1B5 854 aa1.1□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
SENP6-210ENST00000487548 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms