RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480564.1

C9orf135-203, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf135, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-203ENST00000480564 DNAJB13P59910 316 aa6.5□□□□□ -1.37
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C9orf135-203ENST00000480564 ANKRD28O15084 1053 aa6.48□□□□□ -1.37
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C9orf135-203ENST00000480564 FREM3P0C091 2139 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf135-203ENST00000480564 CHN1P15882 459 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf135-203ENST00000480564 SERPINB5P36952 375 aa6.48□□□□□ -1.37
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C9orf135-203ENST00000480564 FHL3Q13643 280 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf135-203ENST00000480564 CBFBQ13951 182 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf135-203ENST00000480564 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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