RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 A0A087WV48 116 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 H7C1C5 153 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TACR3P29371 465 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GALNSP34059 522 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PSMB10P40306 273 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 LCN6P62502 163 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF117Q03924 483 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 BCL2A1Q16548 175 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF74Q16587 644 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 OTPQ5XKR4 325 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF527Q8NB42 609 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 AP3S1Q92572 193 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GHSRQ92847 366 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 OR1F2PQ96R84 312 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DDOQ99489 341 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.1□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CPED1A4D0V7 1026 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 FRG2CA6NGY1 282 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 HCRTR2O43614 444 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PLPP2O43688 288 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TIAF1O95411 115 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SPI1P17947 270 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ITPKBP27987 946 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 BDH1Q02338 343 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 LEG1Q6P5S2 330 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 XKRXQ6PP77 449 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF511Q8NB15 262 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ORAI1Q96D31 301 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PELI1Q96FA3 418 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NANSQ9NR45 359 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 POLHQ9Y253 713 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 C2orf72A6NCS6 295 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PRR32B1ATL7 298 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PLA2G10O15496 165 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DYRK3O43781 588 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PPM1BO75688 479 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PAHP00439 452 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IL12BP29460 328 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GRK6P43250 576 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MAGEB1P43366 347 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PPP3R1P63098 170 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IFITM2Q01629 132 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GPR50Q13585 617 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IL18Q14116 193 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PON3Q15166 354 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CEP76Q8TAP6 659 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TAAR8Q969N4 342 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CLDN23Q96B33 292 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TMCO6Q96DC7 493 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 COQ7Q99807 217 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 BEX2Q9BXY8 128 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MMP25Q9NPA2 562 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GNG8Q9UK08 70 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.09□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 A0A0B4J203 849 aa8.08□□□□□ -1.12
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1B0GX78 115 aa8.08□□□□□ -1.12
CDHR3-211ENST00000478080 FAM25AB3EWG3 89 aa8.08□□□□□ -1.12
CDHR3-211ENST00000478080 FAM25CB3EWG5 89 aa8.08□□□□□ -1.12
CDHR3-211ENST00000478080 FAM25GB3EWG6 89 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms