RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BN98	237 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BHLHE40	O14503	412 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NDUFB2	O95178	105 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	AHSA1	O95433	338 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PEPD	P12955	493 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRB1	P18505	474 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	UQCRC1	P31930	480 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GFRA1	P56159	465 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SGCB	Q16585	318 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SYT14P1	Q58G82	188 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZS92	163 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2T33	Q8NG76	320 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NPAS1	Q99742	590 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	DKKL1	Q9UK85	242 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LAMA5	O15230	3695 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		G3V3Y1	287 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GMFG	O60234	142 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PMS2P2	O95744	297 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNDC12	O95881	172 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	F10	P00742	488 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST1H2AB	P04908	130 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	POU1F1	P28069	291 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A6	P31641	620 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GRK5	P34947	590 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MEOX1	P50221	254 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR85	P60893	370 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	H3F3A	P84243	136 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CD47	Q08722	323 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OCLN	Q16625	522 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TBR1	Q16650	682 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5J2	Q8NH18	312 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3D21	A4FU49	640 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPP3	O14495	311 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SEC14L5	O43304	696 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CLIC3	O95833	236 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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