RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.51□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 M0R233 179 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 FRS3O43559 492 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 KRT33AO76009 404 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 OR12D1P0DN82 309 aa5.51□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.5□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 OR51I1Q9H343 314 aa5.5□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 SYNGR4O95473 234 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 ANXA3P12429 323 aa5.5□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 ZNF91Q05481 1191 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.5□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 ZNF425Q6IV72 752 aa5.5□□□□□ -1.53
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SHQ1-205ENST00000468371 OLIG3Q7RTU3 272 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 C10orf111Q8N326 155 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 COX18Q8N8Q8 333 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 SETD6Q8TBK2 473 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 M1APQ8TC57 530 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM19Q96HH6 336 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 HYLS1Q96M11 299 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-205ENST00000468371 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.5□□□□□ -1.53
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