RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 TOXO94900 526 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 AIFM1O95831 613 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 BCKDHBP21953 392 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 ACVR2AP27037 513 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 GPR68Q15743 365 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 ELP2Q6IA86 826 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 FAM110BQ8TC76 370 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 PMM1Q92871 262 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 TMEM19Q96HH6 336 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 GSX2Q9BZM3 304 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 PCM1Q15154 2024 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 A0A0D9SG52 128 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 TO15178 435 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 B3GALT4O96024 378 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 PPP3CBP16298 524 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 CELP19835 753 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 MAP3K8P41279 467 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 HTR3AP46098 478 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 PITPNBP48739 271 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 GPR143P51810 404 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 EMP3P54852 163 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SPCS2Q15005 226 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 MICAQ29983 383 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 COX20Q5RI15 118 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SLC7A6Q92536 515 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 DIO2Q92813 273 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 MAL2Q969L2 176 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 GPER1Q99527 375 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 MFFQ9GZY8 342 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.09□□□□□ -1.27
USP54-210ENST00000466048 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPL8 197 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ANTXRLA6NF34 631 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 F5H5P2 479 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 ALOX12BO75342 701 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CSTAP01040 98 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 IGHV4-34P06331 123 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 MAOAP21397 527 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 HLA-DMAP28067 261 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GABRA3P34903 492 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 BTG1P62324 171 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 VLDLRP98155 873 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RAPSNQ13702 412 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GXYLT1Q4G148 440 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C22orf42Q6IC83 251 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 FAHD1Q6P587 224 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TEX19Q8NA77 164 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 OR2A14Q96R47 310 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PINK1Q9BXM7 581 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SULT1C4O75897 302 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RENP00797 406 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GIMD1P0DJR0 217 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PVRP15151 417 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PGAM2P15259 253 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TNFSF8P32971 234 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SSTP61278 116 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 GABREP78334 506 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PIGFQ07326 219 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 POU4F2Q12837 409 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 RNF212Q495C1 297 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
USP54-210ENST00000466048 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms