RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZNF682	O95780	498 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	OR1E2	P47887	323 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	CDH12	P55289	794 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	NPTX1	Q15818	432 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	TMEM225	Q6GV28	225 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ZNF613	Q6PF04	617 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	DEF8	Q6ZN54	512 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	BEND4	Q6ZU67	534 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	FITM2	Q8N6M3	262 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	RNF148	Q8N7C7	305 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	TMEM99	Q8N816	258 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	LZIC	Q8WZA0	190 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A4	Q969I6	547 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	FAM162A	Q96A26	154 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WUJ7	227 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ZNF724	A8MTY0	619 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	C16orf97	H3BN30	126 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	GPR171	O14626	319 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	GMNN	O75496	209 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	CBL	P22681	906 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	MNAT1	P51948	309 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	H3F3A	P84243	136 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A3	Q00325	362 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	GPAT4	Q86UL3	456 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	FAM222B	Q8WU58	562 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		15.77	■□□□□ 0.12
USP19-210	ENST00000465902	SH3D21	A4FU49	640 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZNF716	A6NP11	495 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CASK	O14936	926 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	NPIPB7	O75200	414 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	NCK1	P16333	377 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	UGT2B10	P36537	528 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R41	P59536	307 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SELENOW	P63302	87 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	EGR4	Q05215	589 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	KRT72	Q14CN4	511 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PDK3	Q15120	406 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	C16orf89	Q6UX73	402 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TAAR8	Q969N4	342 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	C14orf79	Q96F83	325 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	NSL1	Q96IY1	281 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	EPYC	Q99645	322 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	NDE1	Q9NXR1	346 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		15.76	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	AQP7P3	A6NL99	342 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CHP2	O43745	196 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR2T1	O43869	369 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA1	P01009	418 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	EPX	P11678	715 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR3A2	P47893	321 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IL1RL1	Q01638	556 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CDRT15	Q96T59	188 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	MED18	Q9BUE0	208 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	PRSS50	Q9UI38	385 aa		15.75	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	ABCA4	P78363	2273 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902		B2RBV5	119 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-9	P01782	118 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A1	P53985	500 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	SLC17A1	Q14916	467 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	GLYAT	Q6IB77	296 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CASP12	Q6UXS9	341 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		15.74	■□□□□ 0.11
USP19-210	ENST00000465902	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		15.74	■□□□□ 0.11

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