RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ALOX12BO75342 701 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UPK1BO75841 260 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IGHMP01871 453 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CD1AP06126 327 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF883P0CG24 379 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HSMCR30P0CW71 290 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TACR3P29371 465 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PTGDSP41222 190 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 INAQ16352 499 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ADCK1Q86TW2 530 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MARCH3Q86UD3 253 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 CDK20Q8IZL9 346 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 GATSQ8NAP1 163 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 OR5W2Q8NH69 310 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 TAAR8Q969N4 342 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 OR6C1Q96RD1 312 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 RNF32Q9H0A6 362 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 APMAPQ9HDC9 416 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 KLHL21Q9UJP4 597 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A5Q9Y345 797 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 CFAP54Q96N23 3096 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EML6Q6ZMW3 1958 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ISPDA4D126 451 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDC14CA4D256 554 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.12□□□□□ -1.59
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