RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM229AB2RXF0 380 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 HTR2AP28223 471 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 ADAM8P78325 824 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 MMEL1Q495T6 779 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 CGB2Q6NT52 195 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 PTOV1Q86YD1 416 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 STK35Q8TDR2 534 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 PIF1Q9H611 641 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 SELENONQ9NZV5 590 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 AQP7P3A6NL99 342 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 OPN1SWP03999 348 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 CD3EP07766 207 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 DMTNQ08495 405 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 P3H2Q8IVL5 708 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 WFDC11Q8NEX6 87 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 OR52N5Q8NH56 324 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM2Q9C040 744 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 RNF115Q9Y4L5 304 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PR80 420 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 FBP2O00757 339 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ALG10BQ5I7T1 473 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NCMAPQ5T1S8 102 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 AAED1Q7RTV5 226 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 OR10A6Q8NH74 314 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PERPQ96FX8 193 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM27Q9HBJ8 222 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TAS2R16Q9NYV7 291 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 HS3ST1O14792 307 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NPIPB7O75200 414 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MFN2O95140 757 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PTNP21246 168 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 CBLP22681 906 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 BSPH1Q075Z2 132 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 RBBP4Q09028 425 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TIMM23BQ5SRD1 257 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TSPO2Q5TGU0 170 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TMUB1Q9BVT8 246 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SLC7A10Q9NS82 523 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MALT1Q9UDY8 824 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 OR5H1A6NKK0 313 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 M0QX08 132 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 EGR4Q05215 589 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 KLF10Q13118 480 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 KDM8Q8N371 416 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 LSMEM1Q8N8F7 131 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ZIC4Q8N9L1 334 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MFSD8Q8NHS3 518 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PIP5K1AQ99755 562 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM204Q9BSN7 226 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PTDSS2Q9BVG9 487 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 M0R3H8 397 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 KRT33AO76009 404 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PNMTP11086 282 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 IL1RL1Q01638 556 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 OR1Q1Q15612 314 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 REP15Q6BDI9 236 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ADAM5Q6NVV9 412 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ULK3Q6PHR2 472 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SLC26A7Q8TE54 656 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NEUROG1Q92886 237 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM45BQ96B21 275 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MED4Q9NPJ6 270 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SAR1AQ9NR31 198 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SEC14L4Q9UDX3 406 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 DSCAMO60469 2012 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 LOC100653049A0A140TA62 436 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 DPRXA6NFQ7 191 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 MRASO14807 208 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF9O43307 516 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 KRT34O76011 436 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 ITGA5P08648 1049 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 HOXC12P31275 282 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 P2RY4P51582 365 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 RABL3Q5HYI8 236 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 NANOGP8Q6NSW7 305 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 P2RY8Q86VZ1 359 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 SNX32Q86XE0 403 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM171Q8WVE6 324 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms