RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ADAP00813 363 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 IFNA14P01570 189 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 KDELR2P33947 212 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NTF4P34130 210 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC16A1P53985 500 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CDH12P55289 794 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 LIPEQ05469 1076 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TSC22D1Q15714 1073 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TMEM225Q6GV28 225 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PROX1Q92786 737 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC38A4Q969I6 547 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 POLQO75417 2590 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 A0A087WUJ7 227 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 A0A0B4J2E0 115 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 A0A1B0GX12 115 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FMO6PO60774 539 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PRDX6P30041 224 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC7A2P52569 658 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC17A1Q14916 467 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 POU4F3Q15319 338 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NPTX1Q15818 432 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GPAT4Q86UL3 456 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TAAR8Q969N4 342 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 APH1AQ96BI3 265 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 BAG5Q9UL15 447 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 AQP7P3A6NL99 342 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NME4O00746 187 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OR2T1O43869 369 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 IGHV3-9P01782 118 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PPP3CBP16298 524 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PTNP21246 168 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PSME3P61289 254 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 P2RY6Q15077 328 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZNF613Q6PF04 617 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 Q6ZT83 130 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CDC20BQ86Y33 519 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NRGNQ92686 78 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GSTA4O15217 222 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TNFRSF1BP20333 461 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CBLP22681 906 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 IL32P24001 234 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GSK3BP49841 420 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 P2RY4P51582 365 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ITGADQ13349 1161 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CARM1Q86X55 608 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 KDM8Q8N371 416 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 S100PBPQ96BU1 408 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TPD52L3Q96J77 140 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CREBBPQ92793 2442 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NDUFAB1O14561 156 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 DCTN3O75935 186 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 LYZL6O75951 148 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 VAMP5O95183 116 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 HRGP04196 525 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms