RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD9O00233 223 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR171O14626 319 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A5O76082 557 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SSTR2P30874 369 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GDNFP39905 211 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZSR6 202 aa17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A18Q9H1K4 315 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL21Q9UKT6 434 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA2Q9UM82 520 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CBX7O95931 251 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 UCHL1P09936 223 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2T27Q8NH04 317 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 SELENOFO60613 162 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINI2O75830 405 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM53BQ14153 422 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 FGFBP1Q14512 234 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NRIP3Q9NQ35 241 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SERTAD3Q9UJW9 196 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR10H2O60403 315 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NKX2-2O95096 273 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1D-16P01601 117 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 TOXO94900 526 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HPXP02790 462 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 TPOP07202 933 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 COL19A1Q14993 1142 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG11Q2TAA5 492 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CTHRC1Q96CG8 243 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV4-34P06331 123 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 DNASE1P24855 282 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF81P51508 661 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK2DQ13557 499 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 PON3Q15166 354 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 ZPLD1Q8TCW7 415 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf85Q9H1P6 137 aa17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 CDCP1Q9H5V8 836 aa17.11■□□□□ 0.33
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