RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZAR1Q86SH2 424 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC38A4Q969I6 547 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MCHR1Q99705 422 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITPAQ9BY32 194 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHCGQ9UBD6 479 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NINQ8N4C6 2090 aa8.6□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WUU8 490 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLDN24A6NM45 220 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZAR1LA6NP61 321 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF223E7ERA6 249 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10H3O60404 316 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYPD3O95274 346 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THY1P04216 161 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSMP13725 252 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSTM3P21266 225 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELK4P28324 431 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFNGR2P38484 337 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRISP1P54107 249 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UGT2B15P54855 530 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAS2R41P59536 307 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSNK2BP67870 215 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHL26Q53HC5 615 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF613Q6PF04 617 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC46Q96FV0 321 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCL19Q99731 98 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC13O75165 2243 aa8.59□□□□□ -1.03
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERINC4A6NH21 518 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLF4O43474 513 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FRS3O43559 492 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NGFRP08138 427 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINGO3P0C6S8 592 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPIPA8P0DM63 369 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP4B1P13584 511 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABRB1P18505 474 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHMP24386 653 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HTR2AP28223 471 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OMPP47874 163 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSSP48637 474 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTH2RP49190 550 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYB561P49447 251 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL5RAQ01344 420 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL1RL1Q01638 556 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF773Q6PK81 442 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF550Q7Z398 422 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.58□□□□□ -1.04
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms