RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 A8MV72 311 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 FZD7O75084 574 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 UBL3O95164 117 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PNMTP11086 282 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ARSBP15848 533 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ACVR1BP36896 505 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 KLHL26Q53HC5 615 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 MED25Q71SY5 747 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SSX6Q7RTT6 188 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PLCZ1Q86YW0 608 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF615Q8N8J6 731 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 NPEPL1Q8NDH3 523 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 LILRB4Q8NHJ6 448 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GRPEL2Q8TAA5 225 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SPACA7Q96KW9 195 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 OR10A5Q9H207 317 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A5Q9Y345 797 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 TMEM131Q92545 1883 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PPC4 97 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GZMKP49863 264 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 GDI2P50395 445 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 MMP15P51511 669 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 TNK1Q13470 666 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 HSD17B12Q53GQ0 312 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 OR4K13Q8NH42 304 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 C16orf52Q8NHV5 167 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 TMEM246Q9BRR3 403 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 MARCH7Q9H992 704 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 CAPN10Q9HC96 672 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-205ENST00000409985 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 LILRA5A6NI73 299 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 MCIDASD6RGH6 385 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 IMPA2O14732 288 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 CTDSPLO15194 276 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 FLRT2O43155 660 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 SLC34A2O95436 690 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 OR10A3P58181 314 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 FAM27D1Q5T7N8 215 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 CDH24Q86UP0 819 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 C7orf57Q8NEG2 295 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 ZFAND1Q8TCF1 268 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 C3orf49Q96BT1 292 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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PMS1-205ENST00000409985 COPZ2Q9P299 210 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 H0YIG0 161 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 GYPBP06028 91 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 EPXP11678 715 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 HOXA6P31267 233 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 CAPZBP47756 277 aa21.75■■□□□ 1.07
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PMS1-205ENST00000409985 FNTBP49356 437 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A1P53007 311 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 CD83Q01151 205 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 FAPQ12884 760 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 TCTE1Q5JU00 501 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 WBP2NLQ6ICG8 309 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 YIPF7Q8N8F6 280 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 SNX33Q8WV41 574 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
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PMS1-205ENST00000409985 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 CACNG2Q9Y698 323 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 ZNF879B4DU55 563 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 HRKO00198 91 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 LAMTOR5O43504 91 aa21.75■■□□□ 1.07
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PMS1-205ENST00000409985 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 CEP78Q5JTW2 689 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 RPTNQ6XPR3 784 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 ZNF527Q8NB42 609 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 LRRC61Q9BV99 259 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 ABCG5Q9H222 651 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 NCDNQ9UBB6 729 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 SPATA2Q9UM82 520 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 GLCEO94923 617 aa21.74■■□□□ 1.07
PMS1-205ENST00000409985 BCKDHBP21953 392 aa21.74■■□□□ 1.07
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