RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402583.5

CBX1-203, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene CBX1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-203ENST00000402583 CLUP10909 449 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 IL9P15248 144 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SPI1P17947 270 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CXCR1P25024 350 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PYCR1P32322 319 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 MAP2K3P46734 347 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 RFX2P48378 723 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 OR12D2P58182 307 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ERVK-25P63136 954 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SIRPAP78324 504 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 FOXC1Q12948 553 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SELENBP1Q13228 472 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 KCNAB1Q14722 419 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CDK5R1Q15078 307 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ZNF74Q16587 644 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ALG10Q5BKT4 473 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SLC6A19Q695T7 634 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 LEG1Q6P5S2 330 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PXKQ7Z7A4 578 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 OR1L3Q8NH93 324 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ZNF721Q8TF20 911 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 THAP4Q8WY91 577 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 GHSRQ92847 366 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TSLPQ969D9 159 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TP53INP1Q96A56 240 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SMIM19Q96E16 107 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ADOQ96SZ5 270 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NMNAT3Q96T66 252 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 MNTQ99583 582 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 FOXQ1Q9C009 403 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ZNF221Q9UK13 617 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TMEM131Q92545 1883 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 OR2W5A6NFC9 320 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 HMX3A6NHT5 357 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 FLRT2O43155 660 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NDUFB5O43674 189 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 GDF9O60383 454 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SLC25A12O75746 678 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SC5DO75845 299 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TXNDC12O95881 172 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 RENP00797 406 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 MT-ATP6P00846 226 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 GP1BBP13224 206 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PGCP20142 388 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 RAB3BP20337 219 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 EDNRAP25101 427 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TACR3P29371 465 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SDHAP31040 664 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 HTR3AP46098 478 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CXCL12P48061 93 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PNLIPRP2P54317 469 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CTXN1P60606 82 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 PITPNAQ00169 270 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 E2F1Q01094 437 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CBFBQ13951 182 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 NSDHLQ15738 373 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 CD226Q15762 336 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 TP53I3Q53FA7 332 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1-203ENST00000402583 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms