RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 LINC00862A6NCI5 91 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 LRIT2A6NDA9 550 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SDHBP21912 280 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 LIM2P55344 173 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 DLX5P56178 289 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 HYAL2Q12891 473 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CMC2Q9NRP2 79 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 KIR2DL3P43628 341 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 USP53Q70EK8 1073 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF546Q86UE3 836 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 OR5T1Q8NG75 326 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 C14orf79Q96F83 325 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 FZD7O75084 574 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 B3GALT4O96024 378 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-205ENST00000397611 IFNA4P05014 189 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 FBXO45P0C2W1 286 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CISD3P0C7P0 127 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ENPP2Q13822 863 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 P2RY14Q15391 338 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 NUS1Q96E22 293 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SAMD8Q96LT4 415 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF681Q96N22 645 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 UBQLN3Q9H347 655 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 MYO10Q9HD67 2058 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 MED6O75586 246 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 WDPCPO95876 746 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ACSM4P0C7M7 580 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF250P15622 560 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF823P16415 610 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CSNK1G2P78368 415 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-205ENST00000397611 LMF1Q96S06 567 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 MICU1Q9BPX6 476 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 IL21RQ9HBE5 538 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 A0A087WV62 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 BET1O15155 118 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 FRS3O43559 492 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 PLPP2O43688 288 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 INHAP05111 366 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-205ENST00000397611 TMEM25Q86YD3 366 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 LINC00052Q96N35 136 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-205ENST00000397611 PBX2P40425 430 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 TDGQ13569 410 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-205ENST00000397611 THAP4Q8WY91 577 aa5.05□□□□□ -1.6
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