RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 PGBD2Q6P3X8 592 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 UGT2A3Q6UWM9 527 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 CD300LDQ6UXZ3 194 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 FGD2Q7Z6J4 655 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM239Q8WW34 195 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SARAFQ96BY9 339 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJA3Q96EY1 480 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 ARL5BQ96KC2 179 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM43Q9BTV4 400 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 COL6A6A6NMZ7 2263 aa26.59■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087WUU8 490 aa26.58■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 GJE1A6NN92 205 aa26.58■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 GNAO1P09471 354 aa26.58■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 EDN3P14138 238 aa26.58■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 RBM34P42696 430 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 COX10Q12887 443 aa26.58■■□□□ 1.85
ECHS1-201ENST00000368547 NPRL3Q12980 569 aa26.58■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 C1orf94Q6P1W5 598 aa26.58■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 KLHL15Q96M94 604 aa26.58■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 OR5B2Q96R09 309 aa26.58■■□□□ 1.85
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ECHS1-201ENST00000368547 C1QL3Q5VWW1 255 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 KRT80Q6KB66 452 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 STK35Q8TDR2 534 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 WDYHV1Q96HA8 205 aa26.57■■□□□ 1.84
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ECHS1-201ENST00000368547 A0A0J9YW62 118 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PNR3 127 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PTGS2P35354 604 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 CLK1P49759 484 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 CHN2P52757 468 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN15P56746 228 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 IL1RL1Q01638 556 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf140Q5VVS0 124 aa26.57■■□□□ 1.84
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ECHS1-201ENST00000368547 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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ECHS1-201ENST00000368547 ESRRGP62508 458 aa26.56■■□□□ 1.84
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ECHS1-201ENST00000368547 MEIOBQ8N635 442 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PITX2Q99697 317 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 UCK2Q9BZX2 261 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PNPLA3Q9NST1 481 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 CAMK2AQ9UQM7 478 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 MED31Q9Y3C7 131 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 GTF3C1Q12789 2109 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 RPS5P46782 204 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf46Q6UWT4 87 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 ZER1Q7Z7L7 766 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PFN4Q8NHR9 129 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 POTEKPQ9BYX7 375 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 SLC19A3Q9BZV2 496 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PRDM14Q9GZV8 571 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA13PA6NCF6 341 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 BCKDKO14874 412 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PIP5K1CO60331 668 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 GSTM3P21266 225 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL17Q6TDP4 642 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 PIGXQ8TBF5 258 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRG7Q96K78 797 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 MUS81Q96NY9 551 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 AHSA1O95433 338 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF691Q5VV52 312 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 NRMQ8IXM6 262 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF843Q8N446 348 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 SETD9Q8NE22 299 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 OR5M9Q8NGP3 310 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHS1-201ENST00000368547 TAAR8Q969N4 342 aa26.54■■□□□ 1.84
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