RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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GIPC1-201ENST00000345425 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa24.92■■□□□ 1.58
GIPC1-201ENST00000345425 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GIPC1-201ENST00000345425 ZER1Q7Z7L7 766 aa24.92■■□□□ 1.58
GIPC1-201ENST00000345425 FAM57AQ8TBR7 257 aa24.92■■□□□ 1.58
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF229Q9UJW7 825 aa24.92■■□□□ 1.58
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNHIT1O43257 154 aa24.91■■□□□ 1.58
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GIPC1-201ENST00000345425 B8ZZF3 427 aa24.9■■□□□ 1.58
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GIPC1-201ENST00000345425 MAKP20794 623 aa24.9■■□□□ 1.58
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GIPC1-201ENST00000345425 FEVQ99581 238 aa24.9■■□□□ 1.58
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GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H2ACQ93077 130 aa24.89■■□□□ 1.57
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GIPC1-201ENST00000345425 PTGER4P35408 488 aa24.88■■□□□ 1.57
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GIPC1-201ENST00000345425 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 KLF4O43474 513 aa24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 PRB1P04280 392 aa24.88■■□□□ 1.57
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GIPC1-201ENST00000345425 TRIP10Q15642 601 aa24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 OAFQ86UD1 273 aa24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 OR5J2Q8NH18 312 aa24.88■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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GIPC1-201ENST00000345425 KALRNO60229 2985 aa24.87■■□□□ 1.57
GIPC1-201ENST00000345425 CLCA1A8K7I4 914 aa24.87■■□□□ 1.57
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