RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 B3GALT4O96024 378 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MEF2DQ14814 521 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM69AQ5T7M9 428 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NIPAL3Q6P499 406 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NIPAL2Q9H841 368 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SMCO3A2RU48 225 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAIN1P0CW23 69 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHA5P54756 1037 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RY14Q15391 338 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SGCZQ96LD1 299 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KNG1P01042 644 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGB2P05107 769 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FXYD4P59646 89 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RLIMQ9NVW2 624 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CD300AQ9UGN4 299 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SC5DO75845 299 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DBHP09172 617 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC1A3P43003 542 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FRMD1Q8N878 549 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MVB12AQ96EY5 273 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX37Q96LM6 180 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HYLS1Q96M11 299 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRT1Q99946 306 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM212A6NML5 194 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINE2P07093 398 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF44P15621 663 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ENPP1P22413 925 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PATE1Q8WXA2 126 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51B6Q9H340 312 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM72A0PK05 275 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf72A4D263 438 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CDHR4A6H8M9 788 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 B4DXG7 233 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KLK8O60259 260 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 UPK1BO75841 260 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-ATP6P00846 226 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 EFNA3P52797 238 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SPOCK1Q08629 439 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 G3V3Y1 287 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RRP8O43159 456 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPZBP47756 277 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CARD18P57730 90 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CRMP1Q14194 572 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR176Q14439 515 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM57BQ71RH2 274 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GRINAQ7Z429 371 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNG2Q9Y698 323 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PR48 441 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRA5P31644 462 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP5Q16690 384 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MPEG1Q2M385 716 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 AGBL4Q5VU57 503 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGCQ92535 297 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PPT2Q9UMR5 302 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JMP0 313 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC01565O15544 149 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS19P49795 217 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-16P61578 105 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXK2Q01167 660 aa15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms