RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 TAAR6Q96RI8 345 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PALMDQ9NP74 551 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 LUZP4Q9P127 313 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SPTA1P02549 2419 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 OR10H3O60404 316 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC159P0C7I6 412 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF24P17028 368 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ELK4P28324 431 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ISL1P61371 349 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 EGR4Q05215 589 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 NFATC3Q12968 1075 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MOGQ16653 247 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF691Q5VV52 312 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 RRM2BQ7LG56 351 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SPARTQ8N0X7 666 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 FAM109AQ8N4B1 249 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PFN4Q8NHR9 129 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PIGQQ9BRB3 760 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM43Q9BTV4 400 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MED31Q9Y3C7 131 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CFAP46Q8IYW2 2715 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 RAD23AP54725 363 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SLC10A1Q14973 349 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 LINC00299Q6ZSB3 139 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 LINC00471Q8N535 108 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 BORCS5Q969J3 196 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 RELTQ969Z4 430 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 FEVQ99581 238 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PSD2Q9BQI7 771 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 DEFB127Q9H1M4 99 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SERINC1Q9NRX5 453 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 GALNT8Q9NY28 637 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MED12Q93074 2177 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 A8MVM7 634 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 C1QL1O75973 258 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 GASTP01350 101 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PEPDP12955 493 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ENTPD1P49961 510 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PIGXQ8TBF5 258 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MUL1Q969V5 352 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SFXN2Q96NB2 322 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ACKR4Q9NPB9 350 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF337Q9Y3M9 751 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 E9PQ18 207 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF208O43345 1280 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 NPIPB7O75200 414 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 OPN1LWP04000 364 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CBLP22681 906 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 OMPP47874 163 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 MAP2K6P52564 334 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 GFRA1P56159 465 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CXCR4P61073 352 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 PRKCDQ05655 676 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 CD47Q08722 323 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 KLRB1Q12918 225 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 SELENBP1Q13228 472 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 C3orf33Q6P1S2 294 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 FAHD1Q6P587 224 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 TEX19Q8NA77 164 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 Q8NA96 180 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC78-201ENST00000293889 GPA33Q99795 319 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms