RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 SC5DO75845 299 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 GLSO94925 669 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 BIDP55957 195 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 SLC36A2Q495M3 483 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR4K15Q8NH41 348 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 IL1F10Q8WWZ1 152 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TMEM38AQ9H6F2 299 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 GFYI3L273 518 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 EPHA1P21709 976 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 CRHBPP24387 322 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ZNF616Q08AN1 781 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 RTL6Q6ICC9 239 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.76■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 A0A0G2JMP0 313 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 LINC01565O15544 149 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR8U9P0C7N5 309 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 CCR2P41597 374 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 SLC35D2Q76EJ3 337 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MARCH3Q86UD3 253 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR4M2Q8NGB6 313 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR1J2Q8NGS2 313 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 SORCS2Q96PQ0 1159 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TMEM72A0PK05 275 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ITGB2P05107 769 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 CAV2P51636 162 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 LSAMPQ13449 338 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 NRSN2Q9GZP1 204 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 RLIMQ9NVW2 624 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 SLC22A5O76082 557 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 GPR157Q5UAW9 335 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 VHLLQ6RSH7 139 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 FGF14Q92915 247 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 COQ10AQ96MF6 247 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 NME7Q9Y5B8 376 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MYO7AQ13402 2215 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 A0A1W2PPC4 97 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 GOSR2O14653 212 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 HTR2AP28223 471 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 Q6ZNB5 142 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 NICN1Q9BSH3 213 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MED20Q9H944 212 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ASIC5Q9NY37 505 aa18.75■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 A8MVM7 634 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 PPP2CBP62714 309 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 PPP2CAP67775 309 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 KCNAB1Q14722 419 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 HBMQ6B0K9 141 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 CACNG2Q9Y698 323 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MEF2DQ14814 521 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MPEG1Q2M385 716 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR2G6Q5TZ20 316 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR1S1Q8NH92 325 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 STACQ99469 402 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 PRRT1Q99946 306 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TAF1P21675 1872 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 CBX7O95931 251 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 GPX2P18283 190 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ARL3P36405 182 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 METTL11BQ5VVY1 283 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ZNF454Q8N9F8 522 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TPOP07202 933 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR2T7P0C7T2 308 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR2T27Q8NH04 317 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 METTL9Q9H1A3 318 aa18.74■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MEIS3P1A6NDR6 274 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TUBG1P23258 451 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 GABRA2P47869 451 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 DAPP51397 102 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MFAP5Q13361 173 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 RAB31Q13636 194 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 ZNF684Q5T5D7 378 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 MZB1Q8WU39 189 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 NMNAT3Q96T66 252 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 OR14J1Q9UGF5 321 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 LHX6Q9UPM6 363 aa18.73■□□□□ 0.59
USP25-202ENST00000285681 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms