RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 CADM2Q8N3J6 435 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ZNF615Q8N8J6 731 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 OR4K13Q8NH42 304 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 THAP4Q8WY91 577 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 PRODH2Q9UF12 536 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 SLC6A5Q9Y345 797 aa22.94■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 LANCL1O43813 399 aa22.94■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 MED25Q71SY5 747 aa22.94■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 CDH24Q86UP0 819 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.94■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 HMGB4Q8WW32 186 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.94■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 OR10A5Q9H207 317 aa22.93■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa22.92■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 Q5BKY6 102 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.9■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ARL14Q8N4G2 192 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 EXD3Q8N9H8 876 aa22.9■■□□□ 1.26
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