RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 TO15178 435 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 OR8U9P0C7N5 309 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 G6PDP11413 515 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 GABRA2P47869 451 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 TRAM2Q15035 370 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 RAB11BQ15907 218 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 STEAP3Q658P3 488 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
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USP3-201ENST00000268049 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 MKS1Q9NXB0 559 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.27□□□□□ -1.24
USP3-201ENST00000268049 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 IL21Q9HBE4 155 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CYTIPO60759 359 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 DIRAS1O95057 198 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TXNDC12O95881 172 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 FUCA1P04066 466 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CELP19835 753 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 DRD5P21918 477 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 FAM122BQ7Z309 247 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LAS2Q8IYD9 372 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GALNT16Q8N428 558 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 MROQ9BYG7 248 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR51E2Q9H255 320 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NT5DC2Q9H857 520 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC22A20A6NK97 555 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 PRPS1P60891 318 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 KCNJ11Q14654 390 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 RETREG3Q86VR2 466 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 DUSP13Q9UII6 198 aa7.27□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 VDAC3Q9Y277 283 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.26□□□□□ -1.25
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