RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PSPHP78330 225 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT5Q11128 374 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP6Q5VW22 663 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C18orf63Q68DL7 685 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZS92 163 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MED25Q71SY5 747 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM73Q86UV7 250 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 VRK2Q86Y07 508 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 COX18Q8N8Q8 333 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AMER3Q8N944 861 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A6Q92581 669 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DIO2Q92813 273 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KAT2AQ92830 837 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OTULINQ96BN8 352 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35A4Q96G79 324 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC120Q96HB5 630 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF681Q96N22 645 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP4Q96P64 663 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AICDAQ9GZX7 198 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGUQ9H490 435 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST11Q9NPF2 352 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF21Q9NSA1 209 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IL20Q9NYY1 176 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TCFL5Q9UL49 500 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC16AO15027 2179 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JNG1 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0J9YY10 115 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC182A6NF36 153 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FABP12A6NFH5 140 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CTDSP2O14595 271 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CASKO14936 926 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SURF4O15260 269 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PLOD3O60568 738 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HCN1O60741 890 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TMCC2O75069 709 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SCRG1O75711 98 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR75O95800 540 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HBQ1P09105 142 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 EDN3P14138 238 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2B7P16662 529 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC1A3P43003 542 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OMPP47874 163 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TPTEP56180 551 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2B6P58173 313 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 EFNB1P98172 346 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LGALS3BPQ08380 585 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC13A2Q13183 592 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BIKQ13323 160 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ASAH1Q13510 395 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DS5Q14953 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIQKQ629K1 86 aa6.43□□□□□ -1.38
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