RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SLIT3	O75094	1523 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TYRO3	Q06418	890 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT85	P78386	507 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC14	Q96N46	770 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TCHH	Q07283	1943 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	EVA1C	P58658	441 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	CABP4	P57796	275 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TNNT1	P13805	278 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	PDIA6	Q15084	440 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	JAK2	O60674	1132 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	MYD88	Q99836	296 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482		H3BQV1	296 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CHGB	P05060	677 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF165	P49910	485 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	NR1I2	O75469	434 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	DMTN	Q08495	405 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	A1BG	P04217	495 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	BECN2	A8MW95	431 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A0D9SFI3	127 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.85	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms