RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 NYXQ9GZU5 481 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MX1P20591 662 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GREM2Q9H772 168 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 STAP2Q9UGK3 403 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GYS1P13807 737 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ERFEQ4G0M1 354 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC22Q5TAA0 569 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG9AQ7Z3C6 839 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO3Q9UK99 471 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-215ENST00000628018 EYA2O00167 538 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CIAO1O76071 339 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA6P23229 1130 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A5Q5PT55 438 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 IL15P40933 162 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NFIXQ14938 502 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CARMIL3Q8ND23 1372 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 AOX1Q06278 1338 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TFCP2Q12800 502 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC24Q50LG9 513 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FLAD1Q8NFF5 587 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RTL9Q8NET4 1388 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC12Q96J65 1359 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 AACSQ86V21 672 aa30.57■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CASZ1Q86V15 1759 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TM4SF1P30408 202 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 BAG6P46379 1132 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TSHZ3Q63HK5 1081 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 LRP5O75197 1615 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 TNNI3KQ59H18 835 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR108Q9NPR9 543 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SDSP20132 328 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 ECHDC1Q9NTX5 307 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC15A2Q16348 729 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 GPATCH3Q96I76 525 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 QSER1Q2KHR3 1735 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CNBD1Q8NA66 436 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP3Q96P20 1036 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP126Q9P2H0 1117 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 NLGN1Q8N2Q7 840 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 MSH5O43196 834 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB2P05120 415 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 STK32BQ9NY57 414 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF609O15014 1411 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ERC2O15083 957 aa30.47■■■□□ 2.47
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CAPNS1-215ENST00000628018 DDR1Q08345 913 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR5LQ6MZQ0 368 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC125Q86Z20 511 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC24Q8N4L8 307 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 NPHP1O15259 732 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC45O75419 566 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC24BO95487 1268 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-215ENST00000628018 COL4A1P02462 1669 aa30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL24Q5JXM2 366 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-215ENST00000628018 VGLL2Q8N8G2 317 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.44■■■□□ 2.46
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