RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619529.1

LINC00854-215, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-215	ENST00000619529	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	AOC2	O75106	756 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	RAD17	O75943	681 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	TAF1	P21675	1872 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	GRAP	Q13588	217 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	LAMB2	P55268	1798 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ECE1	P42892	770 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	GRM1	Q13255	1194 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	RALBP1	Q15311	655 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	MAP2K2	P36507	400 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	TNIP1	Q15025	636 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	COL4A1	P02462	1669 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	EGFR	P00533	1210 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	GPSM2	P81274	684 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	PSMD14	O00487	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LINC00854-215	ENST00000619529	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DPF2	Q92785	391 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529		H7C1D1	291 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	HOXB7	P09629	217 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LINC00854-215	ENST00000619529	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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