RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 SP8Q8IXZ3 490 aa14.93□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 GPC2Q8N158 579 aa14.93□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.93□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 SNED1Q8TER0 1413 aa14.92□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 KLRG1Q96E93 195 aa14.92□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.92□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 LAMB2P55268 1798 aa14.92□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 COL4A5P29400 1685 aa14.91□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 LDHDQ86WU2 507 aa14.91□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.9□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 SLC4A2P04920 1241 aa14.9□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.9□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 TAF1P21675 1872 aa14.9□□□□□ -0.02
DDB2-208ENST00000614825 C6orf229H3BNL8 230 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 RIMBP2O15034 1052 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 KSR2Q6VAB6 950 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 TMC4Q7Z404 712 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 IL16Q14005 1332 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.89□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 SCN4AP35499 1836 aa14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 RAD17O75943 681 aa14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 EPS15P42566 896 aa14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 G2E3Q7L622 706 aa14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 GPSM2P81274 684 aa14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CXCL9Q07325 125 aa14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 VPS33BQ9H267 617 aa14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 PDE8AO60658 829 aa14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 SCNN1DP51172 638 aa14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 WASHC4Q2M389 1173 aa14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 WDR63Q8IWG1 891 aa14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.86□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 G3V3G9 751 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 IGKV5-2P06315 115 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 FLIIQ13045 1269 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CNTROBQ8N137 903 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.85□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 TNIP1Q15025 636 aa14.84□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 DOK7Q18PE1 504 aa14.84□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 CREBZFQ9NS37 354 aa14.84□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 POLLQ9UGP5 575 aa14.84□□□□□ -0.03
DDB2-208ENST00000614825 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 VAMP4O75379 141 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 UFL1O94874 794 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 EYA3Q99504 573 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 COL4A1P02462 1669 aa14.83□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 YDJCA8MPS7 323 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 CTSWP56202 376 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 JMYQ8N9B5 988 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 GGA1Q9UJY5 639 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 PASKQ96RG2 1323 aa14.82□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 LTBP1Q14766 1721 aa14.81□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ECE2O60344 883 aa14.81□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.81□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.81□□□□□ -0.04
DDB2-208ENST00000614825 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms