RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC4A2P04920 1241 aa24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 GPC2Q8N158 579 aa24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 VPS33BQ9H267 617 aa24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP350Q5VT06 3117 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 AOC3Q16853 763 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 CHADLQ6NUI6 762 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 KSR2Q6VAB6 950 aa24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC51AQ86UW1 340 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54-211ENST00000609454 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.58■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 HTRA3P83110 453 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 EPHX2P34913 555 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 LDHDQ86WU2 507 aa24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 SNED1Q8TER0 1413 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 PDE8AO60658 829 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 C6orf229H3BNL8 230 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 POTEIP0CG38 1075 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 POTEJP0CG39 1038 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 FLIIQ13045 1269 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 G2E3Q7L622 706 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMB2P55268 1798 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 G3V3G9 751 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 VAMP4O75379 141 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 WASHC4Q2M389 1173 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 KLRG1Q96E93 195 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 EYA3Q99504 573 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 TNIP1Q15025 636 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 IGKV5-2P06315 115 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 SCN4AP35499 1836 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 RIMBP2O15034 1052 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 RAD17O75943 681 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 GPSM2P81274 684 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 CXCL9Q07325 125 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 EPS15P42566 896 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 CTSWP56202 376 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 COL4A5P29400 1685 aa24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 SCNN1DP51172 638 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 GGA1Q9UJY5 639 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTROBQ8N137 903 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 CREBZFQ9NS37 354 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 POLLQ9UGP5 575 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 UFL1O94874 794 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 GCKRQ14397 625 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 LINS1Q8NG48 757 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 TAF1P21675 1872 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 DOK7Q18PE1 504 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 H7C1W4 665 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 H7C1D1 291 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 ECE2O60344 883 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 GREM2Q9H772 168 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms